棉花期货设置两个合约的好处：棉花期货设计了一号棉花合约和二号棉花合约，为妥善解决两个合约的接轨问题，防止出现逼仓风险，设计一号棉花合约的标准仓单，用于二号棉花合约替代交割时同等级升水600元/吨，交割时随货款一并结算。

棉花期货交割仓库的设置充分体现了大品种、大流通和放开交割的思想，棉花交割仓库均设置在主产区或集散地，分布在京广、陇海、京九等主要铁路干线上，内地仓库之间和新疆仓库之间均不设升贴水，库点分布相对集中，库容比较大。

新疆作为我国最大的棉花主产区，正常情况下棉花产量占我国棉花总产量的近三分之一，且高等级棉花所占比例高于内地。如果将新疆地区排除在外，那么，棉花市场的稳定将受到影响。将新疆生产的棉花纳入期货市场体系中，设置交割仓库时，又会因交通而产生负面影响。为了有效地解决这些问题，带动新疆地区经济的发展，创立新疆棉花品牌，更好地发挥期货市场的功能。